خصصت مكتبة الشارقة العامة قسماً للمخطوطات القديمة والكتب ذات الطبعات النادرة ذات القيمة التاريخية والمعرفية ، وذلك لما تحتويه من محتويات علمية وأدبية ، وما تكشفه من تطور في فنون التأليف والنسخ ، مما أدى إلى بدايات العصر. الطباعة الحديثة.

يحتوي القسم على 3،102 كتابًا ، منها 912 من أقدم الكتب والمخطوطات بخمس لغات: العربية والإنجليزية والفرنسية والفارسية والألمانية ، والتي تجذب الباحثين والزوار المهتمين بقراءة الكتب النادرة التي تتنوع موضوعاتها بين كتب اللغة والقواعد والطب ، التفسيرات وغيرها. ومن أقدم المخطوطات النادرة في هذا القسم مجموعة من مخطوطات القرآن الكريم ، أقدمها نسخة من مخطوطة المصحف الشريف المنسوبة لعثمان بن عفان رضي الله عنه ، الذي يتطابق مع النسخة المحفوظة في متحف توبكابي سراي في تركيا. ومن المخطوطات النفيسة في المكتبة نسخة من المخطوطة الشهيرة المعروفة بمقامة الحريري المتوفاة عام 1122 م ، ومخطوطة أخرى بعنوان “شرح قصيدة ابن عبدون” للمؤلف عبد الملك بن عبد الله بن بدرن من. القرن السادس الهجري.

كما يمكن الاطلاع على مجموعة من المجلات العربية النادرة ، مثل مجلة مجمع اللغة العربية بدمشق لعام 1921 ، ومجلة الرسالة التي أصدرها الكاتب أحمد حسن الزيات عام 1933.