حدد القانون 4 موارد مالية لهيئة النقل النهري ، ونصت المادة 18 من القانون رقم 167 لسنة 2022 على إصدار قانون إعادة تنظيم هيئة النقل النهري. تتكون موارد الهيئة مما يلي:

– حصيلة الرسوم المشار إليها في المادة (14) من هذا القانون ومقابل الخدمات التي تحصلها الهيئة من أجهزة الدولة أو القطاع الخاص ، مع عدم الإخلال بالإعفاءات المقررة لتلك الجهات وفقاً للقوانين والقرارات المنظمة.

– حصيلة إدارة واستغلال وتصرف الأراضي والعقارات المملوكة ملكية خاصة للهيئة والتي تزاول أنشطتها فيها ، وعائد استثمار أموال الهيئة.

– الهبات والتبرعات والتبرعات التي يقبلها مجلس الإدارة في ضوء القواعد والأحكام المقررة بهذا الشأن وبما لا يتعارض مع أغراض الهيئة وبعد موافقة الجهات المختصة في الدولة.

– القروض التي يقترحها مجلس إدارة الهيئة على أن يتم إبرامها بما لا يتعارض مع أهدافها ، وباتباع الإجراءات اللازمة والمقررة في هذا الشأن.

عمل التشريع على إعادة تنظيم الهيئة بإحلال الهيئة العامة للنقل النهري محل إدارات الملاحة الداخلية المعنية بالمحافظات ، في إصدار التراخيص الملاحية للوحدات النهرية غير الآلية والعوامات الثابتة والأسماك الذهبية والأطقم العاملة عليها. كما تهدف إلى تحديث البنية التحتية الملاحية من خلال تطوير خطوط الشحن. الأقفال المائية والملاحية بالهيئة وصيانتها بما يحقق الاستفادة منها ، بالإضافة إلى رفع كفاءة مرفق النقل المائي بالمياه الداخلية وتطويرها بما يحقق الاستخدام الأمثل لها وفق أسس فنية واقتصادية سليمة. التأكد من أداء دورها في التنمية الوطنية ووضع تخطيط شامل لمنشأة النقل النهري وكافة الأعمال الصناعية المتعلقة بها واعتماد البرامج والمشاريع اللازمة والإشراف على تنفيذها.

ووفقًا لنص القانون في المادة 12: منح مجلس إدارة الهيئة العامة للنقل النهري – حصريًا – حق ترخيص إنشاء وإدارة وتشغيل وصيانة الموانئ والأرصفة على النيل وقنواته الملاحية ، وتحديد رسوم استعمالها لتداول البضائع والتوريدات والمواد بأنواعها والحاويات وحالات الإعفاء من التراخيص والرسوم وذلك بعد الحصول على موافقة مجلس الوزراء في الحالة. الترخيص بإنشاء الموانئ ، مع الإعفاء من إنشاء المراسي والأرصفة للجهات الأمنية والخدمية الحكومية.