ويعمل مركز الغطاء النباتي على إطلاق مشاريع المراقبة والحماية في جميع أنحاء المملكة، ضمن جهوده لتطوير وحماية المساحات الخضراء، من خلال توفير المعدات اللازمة وتوفير الكوادر الوطنية المؤهلة والمدربة في مجال المراقبة والاتصالات. تنفيذ أنظمة وإجراءات الحماية وفق الأنظمة المعتمدة وأفضل التجارب العالمية في هذا المجال.

تساهم جهود المكافحة والحماية في مكافحة التصحر، من خلال حماية المساحات الخضراء والحفاظ عليها لتحقيق أهداف التنمية المستدامة، والتخفيف من حدة الجفاف وزحف الرمال، حيث إن من أساسيات تنمية وزيادة الغطاء النباتي حمايته في بيئاته الطبيعية و والحفاظ عليها من الممارسات الخاطئة والمخاطر الطبيعية. بدأت فرق الرصد والحماية التابعة للمركز الوطني لتنمية الغطاء النباتي ومكافحة التصحر بمحافظة حفر الباطن؛ وتقوم عملياتها برصد التعديات على المساحات الخضراء ومخالفات اللائحة التنفيذية لنظام البيئة وكشفها والقبض على مرتكبيها واتخاذ الإجراءات القانونية بحقهم. ويضم مشروع مراقبة وحماية الأراضي النباتية بالمحافظة 60 مراقباً بيئياً، و10 مشرفين، و30 سيارة، يعملون على حماية كافة مواقع الغطاء النباتي على مستوى المحافظة، وضبط المخالفين للنظام البيئي بالتنسيق مع الجهات المختصة.