وحدد القانون رقم 79 لسنة 2016 إجراءات إنهاء المنازعات الضريبية، حيث نصت المادة الأولى على أن المنازعات الضريبية القائمة أو الناشئة أمام جميع المحاكم على اختلاف درجاتها، ولجان الاستئناف الضريبي، ولجان التوفيق، ولجان التظلمات، بين مصلحة الضرائب المصرية والممولين أو ويجوز إنهاء دافعي الضرائب الناشئة عن تطبيق أحكام القانون. ضريبة الدخل والقوانين الضريبية الأخرى التي تطبقها الهيئة بغض النظر عن حالة الدعوى أو الاستئناف.

وفقا للمادة الثانية، تتم تسوية النزاع المشار إليه في المادة الأولى من هذا القانون من قبل لجنة أو أكثر، يصدر بتشكيلها قرار من وزير المالية، برئاسة أحد المختصين من ذوي الخبرة من غير العاملين لدى الجهات المختصة. بمصلحة الضرائب المصرية، وعضوية أحد أعضاء الهيئات القضائية بدرجة مستشار على الأقل، وعضو فني من العاملين بمصلحة الضرائب، ولللجنة الاستعانة في أداء أعمالها بمن تراه مناسباً..

ويجب أن يتضمن القرار المذكور عدد اللجان ومقر كل لجنة واختصاصاتها.

ونصت المادة الثالثة على أنه يجب أن يقدم طلب إنهاء النزاع من الممول أو الممول إلى مصلحة الضرائب المصرية على النموذج الذي يحدده وزير المالية. ويجب أن يتضمن الطلب، على وجه الخصوص، موضوع النزاع، ورقم القضية، وطلب التوفيق، والتظلم أو الاستئناف المقدم بشأنه، ومبررات الطلب، بالإضافة إلى صور المستندات المؤيدة له. المرفقة بهذا التطبيق.

ويجب على الهيئة قيد الطلب المذكور في سجل يعد لذلك، وإحالته خلال مدة أقصاها أسبوع من تاريخ تقديمه إلى لجنة تسوية المنازعات المختصة. وإذا قدرت اللجنة مدى جدية الممول أو المكلف في طلب إنهاء الخدمة خلال مدة أقصاها ثلاثين يوماً، وجب على الهيئة إخطار كاتب المحكمة أو أمانة السر. تقدم لجنة الاستئناف أو لجنة التوفيق أو لجنة التظلمات طلب إنهاء الخدمة، ويقوم كاتب المحكمة أو أمانة سر اللجنة برفع ذلك الإخطار إلى رئيس المحكمة أو رئيس اللجنة، حسب الأحوال. يجوز ذلك خلال خمسة أيام من تاريخ وصوله..

المادة الرابعة: يترتب على التبليغ المنصوص عليه في الفقرة الثانية من المادة الثالثة من هذا القانون وقف النظر في الدعوى أو الاستئناف أياً كانت حالته بقوة القانون لمدة ثلاثة أشهر تبدأ من تاريخ في اليوم التالي لانتهاء مدة الخمسة الأيام المشار إليها، ويتجدد الإيقاف تلقائيا لمدة أخرى. وكذلك ابتداء من تاريخ انتهاء فترة التعليق الأولى، ما لم تقم مصلحة الضرائب المصرية بإخطار المحكمة أو اللجنة، بحسب الأحوال، بعدم التوصل إلى إنهاء النزاع..

ويلتزم كاتب المحكمة وأمانة سر اللجنة، بحسب الأحوال، بموافاة الهيئة بنسخ من المستندات المودع منها ملف الدعوى أو الاستئناف إذا طلبت ذلك لعرضه على لجنة فض المنازعات..

ووفقاً للمادة الخامسة، تصدر لجنة إنهاء المنازعات توصيتها بشأن طلب إنهاء المنازعات بعد مراجعة كافة الأوراق والمستندات المقدمة من الطرفين، في ضوء الأصول القانونية المقررة، ووفقاً لظروف كل حالة، وبما يتفق مع أحكام المادة 5. الإجراءات والقواعد التي يصدر بها قرار من وزير المالية في هذا الشأن..

ويجب تقديم التوصية خلال خمسة أيام من تاريخ صدورها إلى الممول أو المكلف أو من ينوب عنهما. فإذا قبلها كتابة خلال الأيام الخمسة التالية، وجب على اللجنة إثبات ذلك في تقرير يقدم إلى وزير المالية أو من يفوضه. وفي حالة الموافقة على التقرير يكون له قوة السند التنفيذي، ويجب على مصلحة الضرائب المصرية إخطار المحكمة أو لجنة الاستئناف أو لجنة التوفيق أو لجنة التظلمات المختصة حتى يعتبر النزاع منتهيًا بقوة القانون..

وإذا رفض الممول أو المكلف قبول توصية لجنة الإنهاء، أو لم يستجب للجنة المشار إليها في الفقرة السابقة، وجب على الهيئة إخطار المحكمة أو اللجنة المختصة بذلك..

ويجوز للممول أو المكلف تقديم هذا الإخطار، وعند انتهاء مدة الإيقاف المنصوص عليها في المادة الرابعة من هذا القانون دون إنهاء النزاع، يستأنف بقوة القانون النظر في طلب التوفيق أو التظلم أو الاستئناف أو الدعوى.